MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 1097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008271	TCGCT	2	10	45	54	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008271	TCGA	2	8	107	114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008271	TCGCT	2	10	116	125	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008271	GTC	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008271	CGC	2	6	254	259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008271	CCACC	2	10	283	292	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_008271	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008271	ACA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008271	GGT	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008271	CCCAC	2	10	2477	2486	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_008271	ACAA	2	8	2491	2498	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008271	CAA	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008271	CCAC	2	8	2586	2593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008271	TGGG	2	8	2617	2624	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008271	ACGA	2	8	2633	2640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008271	CGC	3	9	3610	3618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008271	GCC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008271	GCG	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008271	CGA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008271	CGA	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008271	TCG	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008271	GGC	2	6	7751	7756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008271	GCG	2	6	8599	8604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008271	GGT	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008271	ACC	2	6	9905	9910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008271	CTCG	2	8	9919	9926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008271	TGA	2	6	9962	9967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008271	CCCG	2	8	11877	11884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_008271	AGT	2	6	11905	11910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008271	GC	3	6	14139	14144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008271	CAGGC	2	10	14167	14176	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008271	AC	4	8	14181	14188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008271	GCCG	2	8	14213	14220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008271	CG	3	6	14594	14599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008271	ACG	2	6	14629	14634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008271	ACA	2	6	14635	14640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008271	CGGC	2	8	14651	14658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008271	GGAC	2	8	14662	14669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008271	TGAG	2	8	15253	15260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008271	TGC	2	6	15281	15286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008271	CCTTCG	2	12	15807	15818	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008271	TGC	2	6	15820	15825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008271	CG	3	6	15848	15853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008271	CGC	2	6	15864	15869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008271	CAG	2	6	15947	15952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008271	ACCA	2	8	15964	15971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008271	CCGT	2	8	16025	16032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008271	GAC	2	6	16176	16181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008271	TCC	2	6	16201	16206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008271	CAC	2	6	16215	16220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008271	TTG	2	6	16234	16239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008271	GAT	2	6	16248	16253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008271	GGA	2	6	16257	16262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008271	TCA	2	6	21180	21185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008271	C	6	6	21201	21206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_008271	CCTCA	2	10	28047	28056	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008271	GCA	2	6	28116	28121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008271	ACT	2	6	28176	28181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008271	TCG	2	6	28185	28190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008271	TCG	2	6	28239	28244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008271	CCG	2	6	28248	28253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008271	ACCGC	2	10	28263	28272	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_008271	CGC	2	6	28285	28290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008271	TC	3	6	28312	28317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008271	GTGCGA	2	12	28332	28343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008271	CT	3	6	29172	29177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008271	CCG	2	6	31888	31893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008271	GCC	2	6	31930	31935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008271	GCC	3	9	32020	32028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008271	GAA	2	6	32108	32113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008271	CTG	2	6	32166	32171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008271	CGC	2	6	32172	32177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008271	TGA	2	6	32236	32241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008271	ACG	2	6	32330	32335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008271	GGCC	2	8	33277	33284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008271	GGC	2	6	33313	33318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008271	AAG	2	6	33411	33416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008271	TAC	2	6	33425	33430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008271	CTC	2	6	33869	33874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008271	CAC	2	6	33902	33907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008271	CGG	2	6	33933	33938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008271	GAG	2	6	34455	34460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008271	CGGT	2	8	35195	35202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008271	GCT	2	6	35217	35222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008271	CA	3	6	35244	35249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008271	GGGC	2	8	38794	38801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008271	CAC	2	6	38838	38843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008271	CCT	2	6	39406	39411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008271	CGC	3	9	39436	39444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008271	TGATG	2	10	40385	40394	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008271	CTG	2	6	40528	40533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008271	GGAT	2	8	40534	40541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008271	ACG	2	6	40800	40805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008271	ACG	2	6	40864	40869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008271	AGA	2	6	40906	40911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008271	TC	3	6	42188	42193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008271	CCG	2	6	42213	42218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008271	AAG	3	9	42267	42275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008271	CGT	2	6	42338	42343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008271	GCG	2	6	42389	42394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008271	TAG	2	6	42401	42406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008271	AGGA	2	8	42447	42454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008271	GA	3	6	42453	42458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008271	TCG	2	6	44137	44142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008271	GTAGC	2	10	44175	44184	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008271	GCCC	2	8	44212	44219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_008271	GGT	2	6	44244	44249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008271	TGGTT	2	10	45277	45286	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008271	CCAG	2	8	45287	45294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008271	GCG	2	6	45355	45360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008271	CGG	2	6	45855	45860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008271	TGG	2	6	45866	45871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008271	GTCGA	2	10	45884	45893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008271	GCG	2	6	45947	45952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008271	GCGG	2	8	47462	47469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008271	ATT	2	6	47483	47488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008271	CCG	2	6	49454	49459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008271	C	6	6	49479	49484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_008271	AACGA	2	10	49543	49552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008271	GA	3	6	49584	49589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008271	CGG	3	9	49590	49598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008271	TCA	2	6	49601	49606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008271	GCGT	2	8	49656	49663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008271	GAC	2	6	49717	49722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008271	GCCC	2	8	49830	49837	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_008271	GCCC	2	8	49842	49849	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_008271	GCG	2	6	50111	50116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008271	TCCC	2	8	50202	50209	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_008271	GATCG	2	10	50235	50244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008271	CGA	2	6	50254	50259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008271	GAA	2	6	50266	50271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008271	C	6	6	50289	50294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_008271	GC	3	6	50307	50312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008271	CCA	2	6	50356	50361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008271	CTA	2	6	50377	50382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008271	CTA	2	6	52212	52217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008271	CGG	2	6	52283	52288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008271	CAC	2	6	52352	52357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008271	C	7	7	52377	52383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_008271	GCA	2	6	52415	52420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008271	ACCG	2	8	52433	52440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008271	GGC	2	6	52543	52548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008271	GCG	2	6	52633	52638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008271	CGC	2	6	53207	53212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008271	CAC	2	6	53222	53227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_008271	GTC	2	6	53288	53293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008271	G	6	6	53302	53307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008271	CCG	2	6	53317	53322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_008271	CTG	2	6	53399	53404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008271	GCG	2	6	53411	53416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008271	GGT	2	6	53451	53456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_008271	CGG	2	6	62685	62690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_008271	ACC	2	6	107732	107737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_008271	CGC	2	6	107748	107753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_008271	CTG	2	6	107763	107768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_008271	CGCAA	2	10	107796	107805	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
432	NC_008271	CCT	2	6	108905	108910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_008271	GCC	2	6	109005	109010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_008271	CGG	2	6	109018	109023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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446	NC_008271	TCC	2	6	109714	109719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_008271	ACC	2	6	110470	110475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_008271	GGCA	2	8	110485	110492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
452	NC_008271	CGTAC	2	10	110515	110524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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455	NC_008271	CCA	2	6	112353	112358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_008271	CGA	2	6	112363	112368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_008271	CGA	2	6	112470	112475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_008271	TCG	2	6	112544	112549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_008271	TCG	2	6	112564	112569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_008271	GTG	2	6	112572	112577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
463	NC_008271	CG	3	6	112582	112587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
464	NC_008271	GAA	2	6	114899	114904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_008271	ACG	2	6	118379	118384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_008271	GCG	2	6	119687	119692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_008271	CGTTA	2	10	119720	119729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_008271	CTC	2	6	121170	121175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
489	NC_008271	GC	3	6	121192	121197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_008271	GGT	2	6	121203	121208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
491	NC_008271	CGG	2	6	121226	121231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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